Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A1P20849 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A1P20849 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A1P20849 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A1P20849 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A1P20849 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A1P20849 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A1P20849 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A1P20849 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A1P20849 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A1P20849 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A1P20849 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A1P20849 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A1P20849 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A1P20849 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A1P20849 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A1P20849 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A1P20849 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A1P20849 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A1P20849 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms