Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCLP19338 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCLP19338 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCLP19338 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCLP19338 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCLP19338 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCLP19338 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCLP19338 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NCLP19338 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCLP19338 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCLP19338 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCLP19338 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCLP19338 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCLP19338 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCLP19338 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCLP19338 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCLP19338 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCLP19338 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCLP19338 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCLP19338 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCLP19338 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCLP19338 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCLP19338 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCLP19338 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCLP19338 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCLP19338 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCLP19338 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCLP19338 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCLP19338 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NCLP19338 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCLP19338 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCLP19338 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCLP19338 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCLP19338 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCLP19338 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCLP19338 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCLP19338 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCLP19338 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCLP19338 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCLP19338 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NCLP19338 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCLP19338 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NCLP19338 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NCLP19338 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCLP19338 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCLP19338 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLP19338 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLP19338 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLP19338 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLP19338 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLP19338 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLP19338 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLP19338 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLP19338 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLP19338 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLP19338 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLP19338 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLP19338 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLP19338 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLP19338 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLP19338 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLP19338 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLP19338 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLP19338 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLP19338 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLP19338 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLP19338 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLP19338 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLP19338 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLP19338 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLP19338 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLP19338 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLP19338 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLP19338 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLP19338 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLP19338 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLP19338 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLP19338 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLP19338 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLP19338 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLP19338 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLP19338 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLP19338 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLP19338 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLP19338 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLP19338 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLP19338 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLP19338 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLP19338 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLP19338 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLP19338 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCLP19338 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCLP19338 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCLP19338 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCLP19338 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCLP19338 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCLP19338 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCLP19338 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCLP19338 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NCLP19338 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms