Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF6P18850 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF6P18850 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF6P18850 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF6P18850 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF6P18850 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF6P18850 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF6P18850 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF6P18850 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF6P18850 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF6P18850 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF6P18850 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF6P18850 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF6P18850 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF6P18850 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF6P18850 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF6P18850 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF6P18850 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF6P18850 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF6P18850 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6P18850 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6P18850 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6P18850 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6P18850 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6P18850 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6P18850 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6P18850 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6P18850 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6P18850 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6P18850 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6P18850 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6P18850 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF6P18850 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF6P18850 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF6P18850 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF6P18850 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF6P18850 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF6P18850 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF6P18850 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF6P18850 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF6P18850 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF6P18850 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF6P18850 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF6P18850 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF6P18850 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF6P18850 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF6P18850 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF6P18850 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF6P18850 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6P18850 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6P18850 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6P18850 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6P18850 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6P18850 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6P18850 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6P18850 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6P18850 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6P18850 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6P18850 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6P18850 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6P18850 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6P18850 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6P18850 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6P18850 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6P18850 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF6P18850 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF6P18850 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms