Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCP1P17987 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCP1P17987 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCP1P17987 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCP1P17987 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCP1P17987 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCP1P17987 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCP1P17987 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCP1P17987 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCP1P17987 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCP1P17987 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCP1P17987 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCP1P17987 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCP1P17987 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCP1P17987 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCP1P17987 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCP1P17987 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCP1P17987 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCP1P17987 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCP1P17987 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCP1P17987 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCP1P17987 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCP1P17987 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCP1P17987 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCP1P17987 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCP1P17987 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCP1P17987 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCP1P17987 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCP1P17987 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCP1P17987 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCP1P17987 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCP1P17987 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCP1P17987 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCP1P17987 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCP1P17987 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCP1P17987 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCP1P17987 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCP1P17987 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCP1P17987 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCP1P17987 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCP1P17987 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCP1P17987 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCP1P17987 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCP1P17987 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCP1P17987 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCP1P17987 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCP1P17987 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCP1P17987 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCP1P17987 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCP1P17987 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCP1P17987 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCP1P17987 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCP1P17987 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCP1P17987 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCP1P17987 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCP1P17987 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCP1P17987 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCP1P17987 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCP1P17987 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCP1P17987 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCP1P17987 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCP1P17987 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCP1P17987 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCP1P17987 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms