Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms