Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB8P17481 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms