Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGA1P17096 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms