Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA1P15976 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA1P15976 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA1P15976 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA1P15976 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA1P15976 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA1P15976 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA1P15976 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GATA1P15976 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms