Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPGDP15428 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPGDP15428 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPGDP15428 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HPGDP15428 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HPGDP15428 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPGDP15428 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPGDP15428 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPGDP15428 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPGDP15428 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPGDP15428 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPGDP15428 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPGDP15428 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPGDP15428 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPGDP15428 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPGDP15428 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPGDP15428 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HPGDP15428 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPGDP15428 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPGDP15428 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPGDP15428 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPGDP15428 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPGDP15428 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HPGDP15428 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPGDP15428 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPGDP15428 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPGDP15428 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPGDP15428 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPGDP15428 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPGDP15428 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPGDP15428 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPGDP15428 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPGDP15428 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPGDP15428 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPGDP15428 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPGDP15428 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPGDP15428 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPGDP15428 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HPGDP15428 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HPGDP15428 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HPGDP15428 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HPGDP15428 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HPGDP15428 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPGDP15428 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPGDP15428 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPGDP15428 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPGDP15428 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPGDP15428 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPGDP15428 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPGDP15428 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPGDP15428 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPGDP15428 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HPGDP15428 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPGDP15428 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPGDP15428 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPGDP15428 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPGDP15428 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPGDP15428 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPGDP15428 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPGDP15428 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPGDP15428 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPGDP15428 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPGDP15428 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPGDP15428 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPGDP15428 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPGDP15428 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPGDP15428 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPGDP15428 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HPGDP15428 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPGDP15428 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPGDP15428 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPGDP15428 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPGDP15428 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPGDP15428 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPGDP15428 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPGDP15428 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPGDP15428 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPGDP15428 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HPGDP15428 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HPGDP15428 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HPGDP15428 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms