Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD28P10747 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD28P10747 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD28P10747 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD28P10747 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD28P10747 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD28P10747 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD28P10747 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD28P10747 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD28P10747 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD28P10747 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD28P10747 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD28P10747 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD28P10747 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD28P10747 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD28P10747 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD28P10747 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD28P10747 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD28P10747 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD28P10747 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD28P10747 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD28P10747 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD28P10747 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD28P10747 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD28P10747 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD28P10747 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD28P10747 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD28P10747 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD28P10747 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD28P10747 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD28P10747 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD28P10747 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD28P10747 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD28P10747 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD28P10747 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD28P10747 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms