Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM225BP0DP42 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms