Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
U2AF1L5P0DN76 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2AF1L5P0DN76 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms