Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM10L2AP0DMW4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM10L2AP0DMW4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM10L2AP0DMW4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM10L2AP0DMW4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM10L2AP0DMW4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM10L2AP0DMW4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM10L2AP0DMW4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM10L2AP0DMW4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM10L2AP0DMW4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM10L2AP0DMW4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM10L2AP0DMW4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM10L2AP0DMW4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM10L2AP0DMW4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM10L2AP0DMW4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms