Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSN3P07498 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSN3P07498 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSN3P07498 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSN3P07498 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSN3P07498 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSN3P07498 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSN3P07498 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSN3P07498 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSN3P07498 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSN3P07498 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSN3P07498 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSN3P07498 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSN3P07498 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CSN3P07498 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSN3P07498 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CSN3P07498 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSN3P07498 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSN3P07498 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSN3P07498 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSN3P07498 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSN3P07498 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSN3P07498 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSN3P07498 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSN3P07498 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSN3P07498 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSN3P07498 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CSN3P07498 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSN3P07498 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSN3P07498 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSN3P07498 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CSN3P07498 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CSN3P07498 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CSN3P07498 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CSN3P07498 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CSN3P07498 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSN3P07498 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSN3P07498 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN3P07498 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN3P07498 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN3P07498 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN3P07498 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN3P07498 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN3P07498 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN3P07498 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms