Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FGGP02679 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FGGP02679 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGGP02679 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGGP02679 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGGP02679 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FGGP02679 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FGGP02679 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGGP02679 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGGP02679 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGGP02679 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FGGP02679 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGGP02679 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGGP02679 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGGP02679 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGGP02679 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGGP02679 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGGP02679 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGGP02679 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGGP02679 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGGP02679 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGGP02679 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FGGP02679 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGGP02679 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGGP02679 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGGP02679 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FGGP02679 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGGP02679 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGGP02679 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGGP02679 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGGP02679 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGGP02679 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGGP02679 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGGP02679 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGGP02679 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGGP02679 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGGP02679 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGGP02679 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGGP02679 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGGP02679 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGGP02679 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGGP02679 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGGP02679 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FGGP02679 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms