Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NSD2O96028 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NSD2O96028 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NSD2O96028 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NSD2O96028 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NSD2O96028 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NSD2O96028 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NSD2O96028 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NSD2O96028 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NSD2O96028 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NSD2O96028 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NSD2O96028 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NSD2O96028 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NSD2O96028 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NSD2O96028 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NSD2O96028 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NSD2O96028 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NSD2O96028 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NSD2O96028 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NSD2O96028 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NSD2O96028 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NSD2O96028 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NSD2O96028 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NSD2O96028 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NSD2O96028 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NSD2O96028 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NSD2O96028 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NSD2O96028 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NSD2O96028 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NSD2O96028 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NSD2O96028 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NSD2O96028 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NSD2O96028 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NSD2O96028 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NSD2O96028 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NSD2O96028 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NSD2O96028 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NSD2O96028 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NSD2O96028 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NSD2O96028 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NSD2O96028 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSD2O96028 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSD2O96028 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSD2O96028 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSD2O96028 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSD2O96028 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSD2O96028 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSD2O96028 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSD2O96028 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSD2O96028 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSD2O96028 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSD2O96028 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSD2O96028 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSD2O96028 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSD2O96028 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSD2O96028 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSD2O96028 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSD2O96028 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSD2O96028 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NSD2O96028 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NSD2O96028 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NSD2O96028 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NSD2O96028 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NSD2O96028 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NSD2O96028 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NSD2O96028 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NSD2O96028 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NSD2O96028 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NSD2O96028 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NSD2O96028 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NSD2O96028 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NSD2O96028 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NSD2O96028 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NSD2O96028 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSD2O96028 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSD2O96028 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSD2O96028 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSD2O96028 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSD2O96028 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSD2O96028 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSD2O96028 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD2O96028 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD2O96028 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD2O96028 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD2O96028 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD2O96028 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD2O96028 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD2O96028 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD2O96028 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD2O96028 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD2O96028 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD2O96028 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSD2O96028 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSD2O96028 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSD2O96028 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSD2O96028 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSD2O96028 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NSD2O96028 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSD2O96028 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NSD2O96028 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms