Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms