Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1O95476 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTDNEP1O95476 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1O95476 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms