Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCB11O95342 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms