Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms