Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSO75390 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSO75390 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CSO75390 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CSO75390 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSO75390 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSO75390 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSO75390 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSO75390 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSO75390 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CSO75390 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSO75390 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CSO75390 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSO75390 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CSO75390 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSO75390 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSO75390 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSO75390 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSO75390 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSO75390 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSO75390 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSO75390 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CSO75390 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSO75390 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSO75390 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSO75390 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSO75390 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CSO75390 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSO75390 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSO75390 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSO75390 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSO75390 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CSO75390 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSO75390 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSO75390 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSO75390 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSO75390 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSO75390 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSO75390 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSO75390 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSO75390 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSO75390 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSO75390 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSO75390 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSO75390 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSO75390 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSO75390 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSO75390 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSO75390 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSO75390 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSO75390 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSO75390 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSO75390 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSO75390 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSO75390 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSO75390 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSO75390 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSO75390 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSO75390 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CSO75390 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CSO75390 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSO75390 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSO75390 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSO75390 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSO75390 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSO75390 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSO75390 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSO75390 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CSO75390 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSO75390 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSO75390 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSO75390 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSO75390 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSO75390 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSO75390 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSO75390 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSO75390 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CSO75390 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSO75390 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms