Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX3O75364 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX3O75364 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX3O75364 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX3O75364 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX3O75364 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX3O75364 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX3O75364 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX3O75364 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX3O75364 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX3O75364 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX3O75364 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX3O75364 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX3O75364 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PITX3O75364 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX3O75364 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX3O75364 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX3O75364 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX3O75364 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX3O75364 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX3O75364 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX3O75364 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX3O75364 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX3O75364 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX3O75364 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX3O75364 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX3O75364 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX3O75364 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX3O75364 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX3O75364 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX3O75364 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX3O75364 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PITX3O75364 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PITX3O75364 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PITX3O75364 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX3O75364 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX3O75364 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX3O75364 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX3O75364 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX3O75364 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX3O75364 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX3O75364 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX3O75364 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX3O75364 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX3O75364 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX3O75364 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX3O75364 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX3O75364 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX3O75364 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX3O75364 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX3O75364 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX3O75364 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PITX3O75364 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms