Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP9AO75110 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP9AO75110 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP9AO75110 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP9AO75110 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP9AO75110 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP9AO75110 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP9AO75110 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP9AO75110 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP9AO75110 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP9AO75110 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms