Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SELENOFO60613 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms