Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8B3O60423 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8B3O60423 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms