Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms