Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms