Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX5O60225 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSX5O60225 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX5O60225 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSX5O60225 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX5O60225 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX5O60225 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX5O60225 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX5O60225 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX5O60225 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX5O60225 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX5O60225 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX5O60225 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX5O60225 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX5O60225 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX5O60225 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX5O60225 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX5O60225 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX5O60225 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX5O60225 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX5O60225 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX5O60225 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX5O60225 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX5O60225 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX5O60225 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX5O60225 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX5O60225 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX5O60225 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX5O60225 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX5O60225 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX5O60225 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX5O60225 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX5O60225 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX5O60225 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX5O60225 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX5O60225 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX5O60225 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX5O60225 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX5O60225 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX5O60225 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX5O60225 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SSX5O60225 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SSX5O60225 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SSX5O60225 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX5O60225 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX5O60225 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX5O60225 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX5O60225 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX5O60225 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX5O60225 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX5O60225 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX5O60225 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms