Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA2O43921 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms