Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms