Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATCO43716 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATCO43716 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATCO43716 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATCO43716 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GATCO43716 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GATCO43716 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATCO43716 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATCO43716 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATCO43716 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATCO43716 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATCO43716 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATCO43716 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATCO43716 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATCO43716 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATCO43716 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATCO43716 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATCO43716 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATCO43716 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms