Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF3O43395 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms