Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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