Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACOX3O15254 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms