Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCF2LO15068 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms