Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms