Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAFD1O14545 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAFD1O14545 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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