Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ELL2O00472 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ELL2O00472 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELL2O00472 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELL2O00472 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELL2O00472 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELL2O00472 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELL2O00472 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELL2O00472 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELL2O00472 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELL2O00472 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELL2O00472 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELL2O00472 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ELL2O00472 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ELL2O00472 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ELL2O00472 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ELL2O00472 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ELL2O00472 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ELL2O00472 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ELL2O00472 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ELL2O00472 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ELL2O00472 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ELL2O00472 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ELL2O00472 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ELL2O00472 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ELL2O00472 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ELL2O00472 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ELL2O00472 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ELL2O00472 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ELL2O00472 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ELL2O00472 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ELL2O00472 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ELL2O00472 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ELL2O00472 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ELL2O00472 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ELL2O00472 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ELL2O00472 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ELL2O00472 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ELL2O00472 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ELL2O00472 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ELL2O00472 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ELL2O00472 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ELL2O00472 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ELL2O00472 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ELL2O00472 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ELL2O00472 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ELL2O00472 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ELL2O00472 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ELL2O00472 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ELL2O00472 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ELL2O00472 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ELL2O00472 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ELL2O00472 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ELL2O00472 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms