Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGRNO00468 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGRNO00468 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGRNO00468 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGRNO00468 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGRNO00468 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGRNO00468 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGRNO00468 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGRNO00468 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGRNO00468 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGRNO00468 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms