Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP1O00294 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP1O00294 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP1O00294 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP1O00294 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP1O00294 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP1O00294 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP1O00294 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP1O00294 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP1O00294 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP1O00294 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP1O00294 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP1O00294 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP1O00294 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP1O00294 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP1O00294 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP1O00294 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP1O00294 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP1O00294 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP1O00294 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP1O00294 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP1O00294 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP1O00294 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP1O00294 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP1O00294 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP1O00294 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP1O00294 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP1O00294 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP1O00294 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP1O00294 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP1O00294 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP1O00294 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP1O00294 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP1O00294 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP1O00294 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP1O00294 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP1O00294 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP1O00294 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP1O00294 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP1O00294 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP1O00294 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP1O00294 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP1O00294 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP1O00294 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP1O00294 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP1O00294 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP1O00294 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP1O00294 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP1O00294 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TULP1O00294 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TULP1O00294 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TULP1O00294 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TULP1O00294 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TULP1O00294 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TULP1O00294 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TULP1O00294 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TULP1O00294 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TULP1O00294 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TULP1O00294 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TULP1O00294 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TULP1O00294 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TULP1O00294 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP1O00294 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP1O00294 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP1O00294 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP1O00294 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP1O00294 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP1O00294 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP1O00294 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP1O00294 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP1O00294 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP1O00294 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP1O00294 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms