Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QW42 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QW42 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QW42 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QW42 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QW42 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QW42 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QW42 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QW42 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QW42 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QW42 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QW42 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QW42 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QW42 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QW42 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QW42 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QW42 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QW42 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QW42 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QW42 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QW42 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QW42 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QW42 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QW42 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QW42 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QW42 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
J3QW42 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
J3QW42 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
J3QW42 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
J3QW42 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
J3QW42 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QW42 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QW42 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QW42 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QW42 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QW42 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QW42 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QW42 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QW42 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QW42 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QW42 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QW42 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QW42 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QW42 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
J3QW42 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms