Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3KT08 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3KT08 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3KT08 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3KT08 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms