Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C0C1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C0C1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C0C1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C0C1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C0C1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C0C1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C0C1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C0C1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
H7C0C1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C0C1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C0C1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C0C1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C0C1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C0C1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C0C1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C0C1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C0C1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C0C1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C0C1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C0C1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C0C1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C0C1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C0C1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C0C1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C0C1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C0C1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C0C1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C0C1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C0C1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C0C1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C0C1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C0C1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C0C1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C0C1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C0C1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C0C1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C0C1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C0C1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C0C1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C0C1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C0C1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C0C1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C0C1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C0C1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C0C1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C0C1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C0C1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C0C1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C0C1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C0C1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C0C1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C0C1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C0C1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C0C1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C0C1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C0C1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C0C1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C0C1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms