Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms