Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PP2D1A8MPX8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms