Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms