Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS37CA5D8V6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms