Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC162PA2VCL2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC162PA2VCL2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms