Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf170A2RU37 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms