Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TARSL2A2RTX5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TARSL2A2RTX5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms